Hlavní těžiště analýz laboratoře spočívá ve fyzikálních a chemických rozborech vzorků povrchových a podzemních vod, čistírenských a uhelných kalů a sedimentů. Laboratoř dále zajišťuje odběr vertikálního profilu rybničních nebo jezerních sedimentů ocelovou sondou, která zajišťuje zachování struktury a původního objemu vzorku.

Prováděné analýzy (analýzy se provádějí podle platných norem (ČSN, DIN):

pH, alkalita, sušina, organické látky, NL, popel, konduktivita, CHSK_Cr, turbidita, chlorofyl, absorbance, O₂, spektrofotometrické stanovení významných iontů celkového obsahu živin ve vzorcích vody (NH₄, NO₂, NO₃, PO₄, SO₄, Cl, N_tot, P_tot).

Vybavení laboratoře:

Základní laboratorní vybavení: analytické váhy Sartorius BP 6100 a Kern 770, zařízení pro výrobu demineralizované vody Demiwa 3roi a další.

Speciální laboratorní vybavení: Spektrofotometrický přístroj FiaStar 5000 pro plně automatickou chemickou analýzu živin a jiných parametrů ve vodě a půdě, TitroLine easy – automatické titrační zařízení, automatické měření pH a potenciometrické titrace, Fluorometr Turner – měření zákalu a chlorofylu, a přístroje pro běžné sledování fyzikálně chemických parametrů v terénu (WTW multimetr, digitální konduktometry a pH metry HANNA).